Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB39AQ14964 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms