Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAPQ14761 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms