Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM53BQ14153 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms