Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms