Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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COL9A3Q14050 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A3Q14050 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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