Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK13Q14004 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms