Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX2Q13950 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms