Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF2H3Q13889 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF2H3Q13889 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2H3Q13889 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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