Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms