Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FHL3Q13643 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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