Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms