Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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