Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EIF4EBP1Q13541 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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