Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD4Q13485 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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