Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XRCC4Q13426 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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