Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PMS2P3Q13401 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PMS2P3Q13401 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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