Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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