Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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