Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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