Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TRAF1Q13077 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TRAF1Q13077 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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