Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN3Q13064 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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