Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC16Q13042 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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