Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP3Q12983 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms