Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms