Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms