Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms