Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF4Q08170 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms