Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms