Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms