Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms