Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIN1Q05586 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms