Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms