Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HYI-AS1-201ENST00000444386 545 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PGM5P4-AS1-204ENST00000450636 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms