Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPIBQ01892 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms