Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms