Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFNB1P98172 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms