Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIM1P81133 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIM1P81133 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms