Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX1P78337 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms