Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms