Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS23P62266 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS23P62266 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS23P62266 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms