Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO4P61968 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms