Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms