Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms