Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms