Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MVDP53602 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MVDP53602 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms