Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUCLG1P53597 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms