Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms