Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A2P52657 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms