Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCR4P51679 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCR4P51679 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms