Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LHX2P50458 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms